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中国科学院数学与系统科学研究院朱天琪副研究员应邀做客BESS生态与进化论坛
    2021-05-13  浏览次数:

         2021年5月13日,靠谱的足球投注平台生态与进化论坛系列讲座第十三讲在生态楼409召开。
        此次讲座由中国科学院数学与系统科学研究院副研究员朱天琪主讲,题目为“Maximum likelihood implementation of an isolation-with-migration model for testing gene flow”。首先,专家介绍了关于本次讲座的结构框架,即有关3s模型的假设,这个模型的用处和如何使用该模型。然后从检测基因流和溯祖模型出发,介绍了关于3s模型的假设以及一些其他假设。专家说,分析模型如果检验显著,则表明至少有一个方向的基因流。接着, 专家介绍了时间单位(Time Scaling),强调时间单位要考虑溯祖事件和迁移事件。并介绍了有关模型背后的马氏链(Markov Chain)过程原理。而后,专家介绍了采用最大似然法进行的假设检验,来验证是否存在我们关心的基因流,专家同时强调零模型(迁移事件不存在)是SIM3s模型的一种特殊形式。接着,专家介绍了该模型检验的表现形式,表明该模型一个显著的优点是对数据的分析速度极快,并介绍了类人猿的分析案例。专家也介绍了关于该模型的缺点和所做的一些改动,会产生更多的溯祖树。然后介绍了LRT的假阳性率和loci的关系图,并强调假阳性率越高,检出功效也越高,数据一定要带有外群。最后,专家介绍了3s模型的使用方法、3s数据组织方法及保证收敛和选择正确模型的数据分析技巧。本次讲座在专家与老师和学生们的激烈讨论中结束。

 

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